以下是Distribution 1交换机的MST实例配置：
Distribution 1(config)#spanning-tree mst configuration
Distribution 1(config-mst)#name region1
Distribution 1(config-mst)#revision 10
Distribution 1(config-mst)#instance 1 vlan 10, 30, 100
Distribution 1(config-mst)#instance 2 vlan 20, 40, 200
Distribution 1(config-mst)#exit
Distribution 1(config)#spanning-tree mst 0-1 root primary !--配置Distribution 1作为IST0和MST1两个实例的根交换机
Distribution 1(config)#spanning-tree mst 2 root secondary !--配置Distribution 1作为MST2实例的从根交换机
以下是Distribution 2交换机的MST实例配置：
Distribution 2(config)#spanning-tree mst configuration
Distribution 2(config-mst)#name region1
Distribution 2(config-mst)#revision 10
Distribution 2(config-mst)#instance 1 vlan 10, 30, 100
Distribution 2(config-mst)#instance 2 vlan 20, 40, 200
Distribution 2(config-mst)#exit
Distribution 2(config)#spanning-tree mst 2 root primary !--配置Distribution 2作为MST2实例的根交换机
Distribution 2(config)#spanning-tree mst 0-1 root secondary !--配置Distribution 2作为IST0和MST1两个实例的从根交换机
以下是配置两分布层交换机中的所有中继链路上可以承载所有VLAN通信。
Distribution 1(config)#interface FastEthernet1/0/1
Distribution 1(config-if)#switchport trunk allowed vlan 10,20,30,40,100,200 !--允许在FastEthernet1/0/1中继接口上承载当前实例
!--中的所有VLAN通信
!
Distribution 1(config)#interface FastEthernet1/0/3
Distribution 1(config-if)#switchport trunk allowed vlan 10,20,30,40,100,200
!
Distribution 1(config)#interface FastEthernet1/0/5
Distribution 1(config-if)#switchport trunk allowed vlan 10,20,30,40,100,200
!
Distribution 1(config)#interface FastEthernet1/0/23
Distribution 1(config-if)#switchport trunk allowed vlan 10,20,30,40,100,200
!
Distribution 1(config)#interface FastEthernet1/0/24
Distribution 1(config-if)#switchport trunk allowed vlan 10,20,30,40,100,200
Distribution 2(config)#interface FastEthernet1/0/2
Distribution 2(config-if)#switchport trunk allowed vlan 10,20,30,40,100,200
!
Distribution 2(config)#interface FastEthernet1/0/4
Distribution 2(config-if)#switchport trunk allowed vlan 10,20,30,40,100,200
!
Distribution 2(config)#interface FastEthernet1/0/6
Distribution 2(config-if)#switchport trunk allowed vlan 10,20,30,40,100,200
!
Distribution 2(config)#interface FastEthernet1/0/23
Distribution 2(config-if)#switchport trunk allowed vlan 10,20,30,40,100,200
!
Distribution 2(config)#interface FastEthernet1/0/24
Distribution 2(config-if)#switchport trunk allowed vlan 10,20,30,40,100,200
以下是把两分布层交换机上当前的PVST+模式迁移到MSTP模式。
Distribution 1(config)#spanning-tree mode mst
Distribution 2(config)#spanning-tree mode mst
以下是通过配置Distribution 2交换机上Fa1/0/24端口更高的优先级（优先级值比默认的128更小）来承载MST2实例中的语音通信。注意，这里只需要在中继链路的一端配置即可（当然也可以只配置Distribution 1中的Fa1/0/24端口）。
Distribution 2(config)#interface FastEthernet1/0/24
Distribution 2(config-if)#spanning-tree mst 2 port-priority 64
以下配置是清除原来PVST+模式中的BackboneFast特性配置，并且删除Distribution 2交换机上Fa1/0/24端口的优先级配置。因为在本示例前面的配置中已把Distribution 1作为IST0实例的根交换机，所以Distribution 1也就自然成为了CIST的根。
Distribution 1(config)#no spanning-tree backbonefast
Distribution 2(config)#no spanning-tree backbonefast
Distribution 2(config)#interface FastEthernet1/0/24
Distribution 2(config-if)#no spanning-tree vlan 20,40,200 port-priority 64 !--删除Distribution 2作为VLAN 20、40、200所在实例的
!--根交换机配置（是通过恢复其Fa1/0/24端口优先级为
!--默认的128来实现的）
Distribution 1和Distribution 2交换机是在MST region1（区域1）中，PVST+交换机把region1看成一***立的交换机。你也可以配置利用不同中继端口均衡MST1和MST2两实例中的VLAN通信。