使用 Ports 套件会最终用完磁盘空间。 在通过 ports 联编和安装软件之后，您应记得清理临时的 work 目录， 其方法是使用 make clean 命令。您可以使用下面的命令来清理整个 Ports 套件：
# portsclean -C
随着时间的推移， 您可能会在 distfiles 目录中积累下大量源代码文件。 您可以手工删除这些文件， 也可以使用下面的命令来删除所有 port 都不引用的文件：
# portsclean -D
除此之外， 也可以用下列命令删去目前安装的 port 没有使用的源码包文件：
# portsclean -DD
注意: 这个 portsclean 工具是 portupgrade 套件的一部分。
不要忘记删除那些已经安装， 但已不再使用的 ports。用于自动完成这种工作的一个好工具是 ports-mgmt/pkg_cutleaves port。