我使用的是eclipse Indigo(3.7),设置如下：
window->preferences->svn->Diff Viewer->add
extension or mine-type填入：.c
Program Path填入BeyondCompare的安装地址：D:\Program Files\Beyond Compare 3\BCompare.exe
方框中填入："${mine}" "${base}"
注意两个参数之间要有空格！可以复制上述内容，也可以点方框下面的Variables插入。
如果想设置Merge的参数，按上面相同设置即可。
设置完成后，修改文件，然后commit，弹出要提交的文件列表，点击某个文件，就可以在BC3中查看差异。
